iDeCoは原則60歳まで引き出せませんが、重度の障害を負った場合などは例外として早期引き出しが可能です。まずは加入している金融機関に相談しましょう。
医療保険や就業不能保険の加入、緊急用の預金を別途確保することが重要です。iDeCoはあくまで老後資金のための制度です。
掛金の額を減額したり、一時停止することも可能です。無理のない範囲で継続するか、回復後に再開するのが良いでしょう。